تقع هذه القصة في سلسلة مختلفة من الأحداث، ولا تتبع قانون فيلم Appleseed السابق (على الرغم من إخراجها من قبل نفس مخرج الأفلام السابقة) ؛ إنها قصة بديلة لبداياتهم. برياريوس هو بالفعل سايبورغ ولم ينفصل عن دونان ليتم لم شمله لاحقًا في أوليمبوس للانضمام إلى ESWAT. يصور التفاح ألفا الأيام الأولى لدونان نوت وبرياريوس في القرن الثاني والعشرين، وهما يشرعان في رحلة عبر الأنقاض البائسة في نيويورك بحثًا عن مدينة أوليمبوس. يتم توظيفهم من قبل ذو القرنين، أمير حرب المدينة المدمرة، للقضاء على آلات القتال ذات القدمين. أثناء القتال، يواجهان آيريس وأولسون، وكلاهما في مهمة. دونان وبرياريوس يصادقانهما ويقرران الانضمام إلى مهمتهما. آيريس مكلفة بمنع السايبورغ الخبيث تالوس من الاستيلاء على سلاح سري كان البشر يصنعونه. يستخدم تالوس القزحية لتنشيط آلة الحرب العملاقة.

أغاني النهاية

• Depth" تأدية Yasutaka Nakata