في عالم البوكيون الغامص والمثيرفي وجد العلماء أثار جينية لأقوى وأعظم بوكيمون عرفته البشرية وهو “ميو” فقام العلماء باستنساخه وأوجدو مخلوقا شريراً سمي “ميو تو” لكن تخرج الأمور عن السيطرة ويقدم “ميو تو” على قتل العلماء ويصبح لدى “ميو تو” هدف جديد بأن يغدو أفضل مدرب بوكيمون ولذلك استدعى أفضل مدربي البوكيمون على سطح الارض لمبارزتهم والاطاحة بهم.