يحكي قصة الأنمي عن فتاة تدعى هايدي البنت البالغة من العمر 5 سنوات، توفي والدها عندما كان عمرها سنة واحدة فقط، وإعتنت بها عمتها وقد تعبت عمتها من تربيتها لفترة، فأعطتها إلى جدها الذي يعيش في جبال الألب والذي يخافوا منه أهل القرية، وعاشت عند جدها ومع صديقها اليتيم بيتر البالغ من العمر 11 سنة.