قصة الأنمي تقع بعد 300 عام من الصراع الكبير بين الأرض و المريخ و التي تسمى “الحرب الكارثية” حيث تعيش الأرض في سلام مؤقت بعد أن فقدت العديد من أراضيها في الفضاء بسبب هذه الحرب، امرأة تُدعى كورديليا وصلت إلى الأرض للتحدث حول استقلال مدينة شريز المريخية و التي تقع تحت سيطرة الحكومة الأرضية، ترافقها شركة حماية خاصة تدعى CGS و هما بطلا القصة ميكازوكي أوجوز و أورجا ايتسوكا عندما تُهاجمهم مجموعة تسمى جالارهون، يرى أورجا أنها فرصة للتمرد على CGS و القيام بانقلاب ضدها بسبب اضطهاد البالغين للشباب اليافعين، ميكازوكي و أورجا يتجهان نحو صراع جديد، و من أجل صد مجموعة جالارهون يقوم ميكازوكي بركوب آلة موبايل سوت قديمة من الحرب الكارثية و المدعمة بمفاعل نووي، الجاندام بارباتوس.